MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 6602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018690	ATT	2	6	1397	1402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018690	ATT	2	6	2526	2531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018690	ATTTAA	2	12	3685	3696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018690	TTTTAG	2	12	4292	4303	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018690	AT	3	6	4347	4352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018690	AAAT	2	8	4419	4426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018690	ATTA	2	8	5585	5592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018690	A	7	7	5619	5625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018690	TTAT	2	8	5643	5650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018690	GAT	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018690	TCAA	2	8	6895	6902	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018690	TAA	2	6	6947	6952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018690	AAT	2	6	6966	6971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018690	A	6	6	9265	9270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018690	T	6	6	9289	9294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018690	AAAGT	2	10	11570	11579	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018690	GAG	2	6	12373	12378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018690	T	6	6	13388	13393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018690	TTAT	2	8	13398	13405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018690	AC	3	6	13422	13427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018690	GCGT	2	8	13429	13436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018690	AAT	2	6	13445	13450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018690	TTG	2	6	14149	14154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018690	GTT	2	6	14178	14183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018690	A	6	6	14209	14214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018690	GGC	2	6	15260	15265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018690	A	6	6	15293	15298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018690	A	6	6	15305	15310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018690	TCA	2	6	15321	15326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018690	T	7	7	15328	15334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018690	CGG	2	6	15341	15346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018690	AT	3	6	15370	15375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018690	ATCT	2	8	15449	15456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018690	ATT	2	6	15470	15475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018690	TCAT	2	8	15499	15506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018690	ACT	2	6	16110	16115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018690	T	6	6	16163	16168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018690	GTT	2	6	16169	16174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018690	CAA	2	6	16215	16220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018690	TTAT	2	8	16226	16233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018690	TACC	2	8	16257	16264	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018690	TTA	2	6	16281	16286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018690	A	6	6	16733	16738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018690	T	6	6	16751	16756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018690	A	6	6	16759	16764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018690	T	6	6	16783	16788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018690	GTC	2	6	16837	16842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018690	T	6	6	16875	16880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018690	TAA	2	6	16885	16890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018690	AAT	2	6	16899	16904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018690	CTTT	2	8	16913	16920	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018690	T	6	6	16960	16965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018690	ACC	2	6	17017	17022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018690	T	6	6	17719	17724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018690	T	6	6	17731	17736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018690	A	6	6	17747	17752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018690	ACA	2	6	17761	17766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018690	CTTG	2	8	17770	17777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018690	TTC	2	6	19643	19648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018690	AT	3	6	19650	19655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018690	A	6	6	19664	19669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018690	TGA	2	6	19671	19676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018690	ACT	2	6	19684	19689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018690	T	6	6	19696	19701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018690	T	6	6	22592	22597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018690	TTG	2	6	22616	22621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018690	TTAA	2	8	22657	22664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018690	AAT	2	6	24366	24371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018690	A	6	6	24378	24383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018690	A	7	7	24398	24404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018690	TAA	2	6	25189	25194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018690	TGG	2	6	25217	25222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018690	AATA	2	8	25290	25297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018690	A	7	7	25365	25371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018690	TAAAA	2	10	25394	25403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018690	T	6	6	25892	25897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018690	AC	3	6	25927	25932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018690	TAT	2	6	25949	25954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018690	A	6	6	25969	25974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018690	AAT	2	6	25980	25985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018690	CAT	2	6	26012	26017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018690	AAT	2	6	27477	27482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018690	GCC	2	6	29064	29069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018690	ATGA	2	8	29837	29844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018690	ATA	2	6	29850	29855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018690	TAA	2	6	29944	29949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018690	ATT	2	6	31289	31294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018690	TTA	2	6	31436	31441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018690	A	7	7	31540	31546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018690	GTG	2	6	31547	31552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018690	CAA	2	6	31582	31587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018690	TTG	2	6	31664	31669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018690	TGA	2	6	31830	31835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018690	ATT	2	6	31861	31866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018690	GAA	2	6	31870	31875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018690	AATC	3	12	31992	32003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018690	T	6	6	32020	32025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018690	GTA	2	6	32091	32096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018690	CTAG	2	8	32099	32106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018690	CAT	2	6	33015	33020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018690	GATA	2	8	33023	33030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018690	TA	4	8	33062	33069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018690	TTA	2	6	33127	33132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018690	A	6	6	33176	33181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018690	T	7	7	34750	34756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018690	GAAA	2	8	36078	36085	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018690	ATT	2	6	36103	36108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018690	AAATTT	2	12	36122	36133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018690	T	6	6	37201	37206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018690	A	6	6	39274	39279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018690	T	6	6	39340	39345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018690	AATAC	2	10	42645	42654	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018690	A	6	6	42662	42667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018690	TTA	2	6	46992	46997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018690	ATTA	2	8	49078	49085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018690	T	7	7	49126	49132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018690	TCT	2	6	49134	49139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018690	ATT	2	6	49167	49172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018690	CTG	2	6	49238	49243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018690	GGC	2	6	49252	49257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018690	T	6	6	49263	49268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018690	AATA	2	8	49302	49309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018690	TAT	2	6	49320	49325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018690	AAAT	2	8	49387	49394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018690	TGT	2	6	49407	49412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018690	T	6	6	49424	49429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018690	ATA	2	6	49438	49443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018690	ATT	2	6	49450	49455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018690	T	7	7	49454	49460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018690	T	6	6	50625	50630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018690	ATG	2	6	50650	50655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018690	AAAAG	2	10	50702	50711	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018690	TA	3	6	52010	52015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018690	ATT	2	6	52094	52099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018690	ATT	2	6	54221	54226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018690	ATTGT	2	10	54237	54246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018690	TAAATT	2	12	54270	54281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018690	A	6	6	54321	54326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018690	T	6	6	54369	54374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018690	ATTC	2	8	54375	54382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018690	TAT	2	6	55415	55420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018690	A	6	6	55459	55464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018690	AAC	2	6	56455	56460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018690	AAT	2	6	56469	56474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018690	TAAAA	2	10	56480	56489	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018690	AACA	2	8	56503	56510	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018690	TAAA	2	8	56528	56535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018690	GATT	2	8	56574	56581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018690	T	6	6	56580	56585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018690	TGG	2	6	58014	58019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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